Xiaohui Chen Nielsen, Derya Carkaci, Rimtas Dargis, Lise Hannecke, Ulrik Stenz Justesen, Michael Kemp, Jens Jørgen Christensen et Monja Hammer
Les espèces de cocci à Gram positif et catalase-négatifs n'appartenant pas aux streptocoques ou aux entérocoques sont de mieux en mieux caractérisées et le nombre d'entités taxonomiques augmente régulièrement sur la base d'études taxonomiques moléculaires. Cela complique leur identification. L'analyse de la séquence de la région de l'espaceur intergénique 16S-23S (ITS) s'est avérée être un outil utile pour l'identification des espèces des genres Streptococcus et Enterococcus. Cette étude a examiné la possibilité d'utiliser l'analyse de séquence ITS comme outil commun pour l'identification des espèces au sein des genres Aerococcus, Abiotrophia, Alloiococcus, Dolosicoccus, Dolosigranulum, Facklamia, Granulicatella, Gemella, Ignavigranum, Leuconostoc et Vagococcus. Les séquences ITS de 29 souches types et de 103 souches cliniques bien caractérisées ont été déterminées et une analyse BLAST a été réalisée pour l'identification des espèces. Toutes les souches cliniques ont été identifiées de manière convaincante au niveau de l'espèce. L'analyse phylogénétique a montré un regroupement distinct des souches avec les espèces attribuées et les souches types respectives. Ainsi, l'analyse de séquence ITS a été utile pour l'identification des espèces de bactéries appartenant aux genres qui sont des cocci catalase-négatifs et Gram-positifs. Potentiellement, l'ITS pourrait être considéré comme le premier outil d'identification pour le groupe de cocci catalase-négatifs et Gram-positifs, y compris les streptocoques non hémolytiques, les entérocoques et les taxons examinés dans cette étude.