Journal de socialomique

Abstrait

ENQUÊTE SUR LES NÉMATODES PLANTOPARASITES ASSOCIÉS AUX CULTURES DE BLÉ EN AFRIQUE DU SUD

Lamula Siphamandla

La culture des céréales en Afrique, en particulier en Afrique subsaharienne, est confrontée aux effets combinés des stress abiotiques (notamment la sécheresse et les mauvaises technologies de gestion des cultures) et biotiques (maladies fongiques et ravageurs). Parmi ceux-ci, les nématodes à kyste des céréales (CCN) (Heterodera spp.), les nématodes à galles (RKN) (Meloidogyne spp.) et les nématodes à lésions racinaires (RLN) (Pratylenchus spp.) sont les principaux facteurs limitant la production de céréales et sont considérés comme économiquement importants pour le blé dans le monde entier et comme des facilitateurs majeurs d'infections fongiques telles que les espèces de fusarium. Les pertes de céréales dues aux nématodes parasites des plantes (PPN) sont estimées entre 6,9 ​​et 50 % (125 milliards de dollars US) dans le monde. Les dommages causés par ces PPN, leur comportement et leur contrôle ont reçu peu d'attention dans de nombreux pays africains, en particulier en Afrique subsaharienne, malgré les indications d'autres pays selon lesquelles la productivité des céréales peut être sévèrement réduite. L'étude actuelle vise à identifier les assemblages de nématodes parasites des plantes dans les zones de production de blé d'Afrique du Sud, en mettant l'accent sur l'identification morphologique et moléculaire. Au total, 776 échantillons composites de sol et de racines de rhizosphère ont été collectés dans 24 localités sur deux saisons dans les provinces de l'État libre (4), du KwaZulu-Natal (1), du Cap Nord (6) et du Cap occidental (13). Les nématodes ont été extraits d'échantillons de sol et de racines en utilisant la méthode adaptée de décantation et de tamisage, suivie d'une méthode adaptée de centrifugation du sucre. Les nématodes ont été extraits des grains en trempant les échantillons dans de l'eau pendant 24 heures et en décantant l'extrait à travers un tamis de 20 μm. Les espèces de nématodes ont été identifiées sur la base de caractéristiques morphométriques et morphologiques, tandis que les valeurs de proéminence (PV) ont été calculées pour chaque genre ou famille. Des individus des genres/familles/ordres suivants ont été identifiés dans les provinces suivantes : État libre : Pratylenchus, Rotylenchus, Scutellonema, Helicotylenchus, Criconema et Dolichodorus ; KwaZulu-Natal : Meloidogyne, Pratylenchus, Criconema, Spiral et Longidorus ; Cap-Nord : Pratylenchus, Criconema et Spiral ; Cap-Occidental : Pratylenchus, Rotylenchus, Scutellonema, Helicotylenchus, Coslenchus, Tylenchus et Xiphinema. Selon la valeur PV, les genres prédominants identifiés à ce jour dans les localités sont Pratylenchus, Meloidogyne, Spiral, Coslenchus, Tylenchus, Criconema, Longidorus et Xiphinema. Cedara au KwaZulu-Natal avait un nombre élevé de Meloidogyne (420 juvéniles de deuxième stade / 200 g de sol) par rapport aux autres localités échantillonnées. Le Cap occidental (Malmesbury) a montré un nombre élevé de Pratylenchus sp. (8750 / 200 g de sol). Dans les échantillons de racines, le PV de Meloidogyne à Cedara était de 183, suivi de De Vlei (PV = 943), Tygerhoek (PV = 490), Kopporfontein (PV = 134) et Wellington (PV = 57) pour Pratylenchus sp. Aucun nématode parasite des plantes n'a été trouvé dans les échantillons de grains. Cependant, une espèce bactérivore de Panagrolaimus a été identifiée à partir de grains de blé de Clarens dans l'État libre,Il s'agit du premier signalement en Afrique du Sud et dans le monde entier. Les techniques D2-D3, 18S rRNA, ITS, PCR et SCAR-PCR pour l'amplification des genres détectés sont en cours et jusqu'à présent, parmi d'autres espèces économiquement importantes, telles que Pratylenchus thornei, Pratylenchus neglectus et Pratylenchus Bolivian ont été amplifiées et les données correspondent à celles des identifications morphologiques et morphométriques. En raison de leur taille microscopique, les nématodes nuisibles sont souvent négligés ou mal diagnostiqués.