Journal de bactériologie et parasitologie

Abstrait

Comparaison au niveau des systèmes de Mycobacterium tuberculosis , Mycobacterium leprae et Mycobacterium smegmatis basée sur une analyse de réseau d'interaction fonctionnelle

Richard O Akinola, Gaston K Mazandu et Nicola J Mulder

Mycobacterium leprae est une bactérie pathogène responsable de la lèpre, une maladie qui affecte principalement la peau, les nerfs périphériques, les yeux et les muqueuses des voies respiratoires supérieures. Malgré les progrès significatifs enregistrés ces dernières années pour enrayer cette maladie grâce à une stratégie de polychimiothérapie (PCT), de nouveaux cas de la maladie sont signalés chaque année. Selon l'Organisation mondiale de la santé, 192 242 nouveaux cas ont été recensés au début de l'année 2011. Mycobacterium leprae ne peut pas être cultivé en laboratoire mais peut être cultivé dans les coussinets des pattes de souris et plus récemment chez les tatous à neuf bandes en raison de sa sensibilité à la lèpre. Son génome très réduit en fait une espèce intéressante comme modèle d'évolution réductrice au sein du genre mycobactérien ; il partage le même ancêtre avec Mycobacterium tuberculosis (MTB). Un réseau fonctionnel pour MTB a été généré précédemment et des analyses informatiques approfondies ont été menées pour révéler l'organisation biologique de l'organisme sur la base des propriétés topologiques du réseau. Nous utilisons ici des séquences génomiques et des données fonctionnelles issues de bases de données publiques pour construire des réseaux fonctionnels protéiques pour une autre bactérie à croissance lente, Mycobacterium leprae (MLP) et pour Mycobacterium smegmatis (MSM), une bactérie non pathogène à croissance rapide. Avec le réseau MTB, cela offre la possibilité de comparer trois mycobactéries ayant des génomes de tailles différentes. Dans cet article, nous utilisons des mesures de centralité de réseau pour comparer systématiquement MTB, MLP et MSM afin de quantifier les différences entre ces organismes au niveau de la biologie des systèmes et d'étudier la biologie et l'évolution des réseaux.