Biologie unicellulaire

Abstrait

Technique de détection moléculaire accentuée pour séparer et identifier les helminthes des poissons grâce à l'analyse de fusion à haute résolution (HRM)

Neeshma Jaiswal, Rashmi Tripathi et Sandeep K Malhotra

Une PCR en temps réel couplée à une analyse moléculaire à haute résolution (HRM) a été réalisée pour cibler le deuxième espaceur interne transcrit (ITS-2) de l'ADN ribosomal nucléaire. Ce dernier a servi de marqueur génétique pour identifier et distinguer deux espèces d'anisakidés et une espèce de cucullanide parasitant les poissons marins et d'eau douce. Des caractéristiques uniques et distinctes des modèles HRM ont été produites pour chacun des trois vers ronds étudiés. Les profils de fusion et le seuil des cycles (valeurs Ct), auxquels l'amplification a commencé, pour Anisakis simplex (Rudolphi), Contrcaecum osculatum (Rudolphi) Dujardin, Contrcaecum sp. et Dacnitoides cotylophora (Ward et Magath) ont permis de diagnostiquer les espèces. Les analyses moléculaires par séquençage et comparaison de l'espaceur interne transcrit (ITS) de l'ADN ribosomal des essais de Dacnitoides, Anisakis et Contrcaecum ont établi leur identité distincte. La présente étude propage l’analyse moléculaire-phylogénétique et morpho-moléculaire pour caractériser les constituants diagnostiques des vers ronds cucullanidés et anisakidés.