Génétique héréditaire : recherche actuelle

Abstrait

Activation des rétrotransposons du groupe Ty1-copia de Dendrobium officinale dans des conditions de stress abiotique

Cong Li, Yuan Jiang, Yanhui Gao, Jinping Si

Français En utilisant l'amorce universelle Ty1-copia rétrotransposon transcriptase inverse (RT), le domaine de transcriptase inverse conservé d'environ 260 pb, qui a été induit par le stress dû au froid et au stress osmotique, a été amplifié par RTPCR du Dendrobium officinale dans cette étude, indiquant que le rétrotransposon pourrait être activé par des conditions de stress. Les amplicons ont été récupérés et clonés pour séquençage et analyse par un logiciel bioinformatique associé. 78 RT de rétrotransposon de type Ty1-copia activées transcriptionnellement ont été obtenues avec une grande hétérogénéité. La longueur de ces séquences variait de 245 à 265 pb, toutes les séquences étaient riches en AT et l'homologie variait de 42,9 % à 99,2 %. Il en va de même pour la RT de rétrotransposon de type Ty1-copia du génome, différents éléments régulateurs agissant en cis induits par des conditions de stress et les signaux de départ de la transcription, correspondant à la boîte CAAT, aux séquences conservées de la boîte TATA et à certains autres éléments régulateurs. Français Les éléments régulateurs cis-agissants induits par des conditions de stress de la transcriptase inverse activée transcriptionnellement des rétrotransposons Ty1-copia étaient significativement plus élevés que la RT du rétrotransposon de type Ty1-copia du génome. Une fois traduites en acides aminés, certaines séquences présentaient une mutation du codon stop ou/et une mutation par décalage de cadre, et toutes les séquences présentaient une mutation dans la séquence conservée « SLYGKQ ». Quatre catégories ont été identifiées par analyse phylogénétique après des analyses d'alignement de leurs séquences d'acides aminés, et avec la RT du rétrotransposon de type Ty1-copia du génome ayant une faible homologie, ce qui indique que la transcriptase inverse activée transcriptionnellement des rétrotransposons Ty1-copia, qui induit dans des conditions de stress, présentait des différences significatives avec la RT du rétrotransposon de type Ty1-copia du génome.