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Abstrait
Progrès dans les outils bioinformatiques pour le séquençage à haut débit des données de méthylation de l'ADN
Jianzhong Su, Dan Huang, Haidan Yan, Hongbo Liu et Yan Zhang
La méthylation de l'ADN joue un rôle crucial dans la régulation de l'expression des gènes au cours du développement et de la différenciation cellulaires. Récemment, les technologies de séquençage de nouvelle génération (NGS) ont révolutionné l'étude des profils globaux de méthylation de l'ADN. L'analyse des profils de méthylation de l'ADN à l'échelle du génome est essentielle pour comprendre les mécanismes sous-jacents de la méthylation de l'ADN. Nous avons examiné ici plusieurs techniques de séquençage de nouvelle génération couplées à différentes méthodes de prétraitement (digestion par endonucléase, enrichissement par affinité et conversion au bisulfite) et avons résumé les outils et ressources bioinformatiques relatifs pour une analyse plus approfondie de la méthylation de l'ADN.