Ismaïl Saadoun
Les infections microbiennes sont reconnues comme un problème important en raison de l'émergence de souches résistantes à de multiples antibiotiques. Par conséquent, il reste nécessaire de trouver de nouveaux antibiotiques avec un large spectre d'activité. L'une de ces approches consiste à étendre l'activité de criblage du genre Streptomyces car il abrite un grand nombre de producteurs d'antibiotiques. Plusieurs études sur l'isolement, la caractérisation et le génotypage des streptomycètes du sol de Jordanie et des Émirats arabes unis ont déjà été menées et l'activité in vitro des isolats récupérés a été explorée vers plusieurs pathogènes multirésistants. Les conditions optimales de production des substances actives par les souches de Streptomyces les plus actives ainsi que leur extraction et leur purification ont également été étudiées. Le séquençage du génome entier à l'aide d'Illumina a été effectué sur les souches isolées de la région des Émirats arabes unis. Les recherches ont révélé l'identification d'une souche de Streptomyces productrice d'antibiotiques pour inhiber tous les organismes testés avec l'observation de différentes valeurs Rf et spectres d'absorption UV des substances actives de certains médicaments testés. Aucun plasmide de faible poids moléculaire n'a été détecté dans ces souches, ce qui suggère que leur production d'antibiotiques est probablement de l'ADN codé par des chromosomes. L'amplification par PCR d'une séquence spécifique au genre dans le gène 16S rADN des Streptomyces a permis la détection rapide et directe des espèces de Streptomyces productrices de streptomycine dans le sol. Le séquençage du génome entier a montré que les souches partageaient des lignées phylétiques distinctes, mais apparentées, avec d'autres espèces de Streptomyces. L'analyse AntiSMASH a identifié de nombreux groupes de gènes biosynthétiques (BGC) ayant des propriétés antimicrobiennes. Le fait que ces souches de Streptomyces aient montré une activité antibiotique contre tous les agents pathogènes testés et aient été récupérées dans des habitats asséchés sous-explorés en Jordanie et aux Émirats arabes unis dans des conditions environnementales difficiles peut soutenir l'idée de produire de nouveaux antibiotiques dans de telles conditions. Tous les criblages en laboratoire d'antibiotiques producteurs de Streptomyces serviraient de base à la bio-industrie.