Journal de pathologie végétale et de microbiologie

Abstrait

Caractérisation biologique et diversité génétique des souches indiennes de Ralstonia solanacearum Biovars 3 et 4 responsables du flétrissement bactérien de la tomate

Dinesh Singh, Shweta Sinha, Garima Chaudhary et Yadav DK

Les biovars 3 et 4 de Ralstonia solanacearum responsables du flétrissement bactérien de la tomate (Solanum lycopersicum L.) sont des agents pathogènes dévastateurs des plantes transmises par le sol dans le monde entier. Quatre-vingt-sept isolats de R. solanacearum ont été isolés à partir de plants de tomates flétris des États indiens de Jammu-et-Cachemire, Himachal Pradesh, Uttarakhand, Jharkhand et Orissa et caractérisés par des méthodes traditionnelles et moléculaires. Le biovar de R. solanacearum a été déterminé à l'aide d'un ensemble de sources de carbone et il a montré que le biovar 3 de R. solanacearum était le plus important (90,2 %) dans tous les États de l'Inde, tandis que le biovar 4 était trouvé dans les États du Jharkhand et de l'Himachal Pradesh. Français La PCR multiplex spécifique du phylotype a attribué les 87 isolats de R. solanacearum infectant la tomate au phylotype I. Pour étudier la diversité génétique, des approches de typage de séquences BOX-PCR et multilocus ont été utilisées. Les produits d'amplification ont donné un modèle d'empreinte digitale BOX-PCR allant de 500 pb à 4 kb et ont trouvé 23 groupes de typage d'ADN de 87 isolats de R. solanacearum à un coefficient de similarité de 50 %. Sous typage de séquence multilocus, trois gènes de virulence, à savoir, hrp (régulation de la transcription régulatrice) et egl (précurseur de l'endoglucanase) et les gènes fli C de 18 souches de R. solanacearum appartenant à différentes zones agro-climatiques ont été réalisés. Sur la base de l'analyse de séquence du gène egl, la majorité des souches indiennes de R. solanacearum étaient très proches les unes des autres, à l'exception d'ORT-8, UTT-23 et JHT2 et elles étaient très proches de la souche GMI1000. Une grande variabilité génétique a été trouvée dans les isolats indiens de R. solanacearum, indépendamment du lieu d'isolement et des conditions climatiques.