Génétique héréditaire : recherche actuelle

Abstrait

Brefs échanges sur la sélection des régions génomiques et des gènes liés aux caractères d'adaptation et de fertilité de deux races bovines créoles colombiennes

C. De León, R. Martinez

La sélection naturelle et la domestication des espèces animales sont l'un des principaux changements évolutifs entraînant des adaptations phénotypiques ; ces modèles créent des signatures génétiques au sein du génome. Pour découvrir les signatures et les gènes impliqués dans les traits d'adaptation et de fertilité chez deux races bovines créoles colombiennes, Blanco orejinegro (BON) et Sanmartinero (SM), dans la présente étude, des régions génomiques sélectionnées ont été détectées en comparant les différences de déséquilibre de liaison régional (LD) à l'aide de 58 868 polymorphismes nucléotidiques simples (SNP) de BON et de 57 482 SNP de SM. La variation du LD à l'échelle du génome entre les populations a également été estimée à l'aide du programme VARLD. Les 0,1 et 0,01e percentiles supérieurs des scores VarLD standardisés ont été utilisés comme critère pour toutes les comparaisons. Dix régions ont été détectées sur les chromosomes 3, 5, 11, 15, 18, 21, 22, 23, 25 et 29 et des gènes tels que CTDSP2, CES1, CFAP161, CLEC14A, HIPK1, RBM4, KDMID, OLFML3, ATP23, LRRTM1, SLC6A2, DEK, SYT6, KDMID impliqués dans les caractères d'adaptation et de fertilité. Ces résultats ouvrent la perspective de développer de nouvelles études sur d'autres races bovines et d'autres espèces d'élevage qui serviront de support aux programmes d'amélioration génétique et de conservation.