Journal of Aquaculture Research & Development

Abstrait

ADNc codant pour la chitine synthase de la crevette (Pandalopsis Japonica) : caractérisation moléculaire et analyse de l'expression

Md. Hasan Uddowla, Ah Ran Kim, Won-gyu Park, Hyun-Woo Kim*

La croissance des crustacés se produit par mue, la perte périodique de l'exosquelette. La compréhension des gènes impliqués dans le métabolisme de la chitine associé au cycle de mue périodique est importante pour diverses applications à l'aquaculture de crustacés décapodes. La chitine synthase est une enzyme importante dans la voie de biosynthèse de la chitine qui joue un rôle majeur dans la synthèse de la nouvelle cuticule après la mue. Dans cette étude, nous avons isolé un ADNc complet codant pour la chitine synthase (PajCHS) de Pandalopsis japonica grâce à une combinaison de clonage basé sur la PCR (Polymerase Chain Reaction) et d'analyse bioinformatique. Le PajCHS identifié code une protéine transmembranaire avec 1525 résidus d'acides aminés (175 kDa). La comparaison avec d'autres CHS d'insectes a révélé que PajCHS contient trois domaines : le domaine N-terminal A, le domaine catalytique B et le domaine C-terminal C. Trois motifs conservés (EDR, QRRRW et SWGTR) étaient également bien conservés dans et à proximité du domaine catalytique B, ce qui suggère que Paj-CHS est fonctionnellement actif. La variation de l'hélice transmembranaire dans les domaines N-terminal et C-terminal suggère que l'orientation de chaque CHS peut être différente. L'analyse phylogénétique suggère que PajCHS est un orthologue des membres du groupe CHS1 des espèces d'insectes. Cependant, les profils d'expression tissulaire ont indiqué que l'épiderme, l'hépatopancréas, l'intestin et les branchies étaient les principaux sites de production du transcrit PajCHS, qui est considérablement différent du CHS1 des insectes. Les résultats de la qPCR ont montré que l'ablation du pédoncule oculaire et l'injection de 20 hydroxyecdysone (20E) augmentaient le niveau d'expression de l'ARNm de PajCHS, suggérant que l'expression de PajCHS1 pourrait être contrôlée par le 20E endogène.