Journal de la technologie microbienne et biochimique

Abstrait

Caractérisation de la morphologie fongique à l'aide de techniques d'analyse d'images numériques

Maria Papagianni

L'utilisation de champignons filamenteux pour la production de produits commercialement importants est ancienne mais continue d'augmenter au cours des dernières décennies. De nouvelles classes de composés s'ajoutent à la liste des produits des fermentations fongiques en raison des progrès des méthodologies et des applications de la biotechnologie. Les champignons sont des organismes morphologiquement complexes qui diffèrent en structure tout au long de leur cycle de vie. Dans la fermentation submergée, la morphologie fongique peut prendre des formes distinctes allant de filaments dispersés à des masses de mycélium densément entrelacées appelées pastilles. Chaque forme morphologique a ses propres caractéristiques qui ont un impact critique sur le résultat global du processus. La croissance dispersée donne des bouillons très visqueux avec un comportement pseudoplastique qui a un impact négatif sur les taux de transfert de masse et d'énergie, ce qui entraîne des besoins d'apport énergétique plus élevés. En raison de la grande pertinence industrielle de la morphologie fongique, il y a eu un développement substantiel d'outils et de techniques pour caractériser la morphologie et extraire des informations quantitatives qui peuvent être utilisées dans les études de contrôle et d'optimisation des processus. L'analyse d'images numériques est la méthode de pointe pour caractériser et quantifier la morphologie fongique dans le processus de développement, des spores aux structures filamenteuses jusqu'aux granulés. Les progrès réalisés dans ce domaine depuis les années 1990, lorsque les premières méthodes d'analyse d'images ont été décrites, sont discutés en détail tout au long de la revue.