Dongwei Hou, Shenzheng Zeng, Jian Liu, Muting Yan, Shaoping Weng, Jianguo He Jianguo He et Zhijian Huang
Cette recherche décrit les compositions des communautés et les taxonomies dominantes des microbes procaryotes et eucaryotes dans 30 échantillons d'eau provenant de 5 différents étangs de crevettes blanches du Pacifique. La région V4 du gène 16S rRNA et du gène 18S rRNA a été séquencée par une technologie de séquençage à haut débit. Au total, 1 387 317 fragments de gènes 16S rRNA et 1 612 056 fragments de gènes 18S rRNA ont été sélectionnés pour la classification, dont 3 841 unités taxonomiques opérationnelles (OTU) procaryotes et 990 OTU eucaryotes. Il a été observé que toutes les séquences 16S rRNA étaient affiliées à au moins 47 divisions bactériennes et que les séquences 18S rRNA étaient affiliées à 50 divisions eucaryotes, respectivement. Français Parmi les 30 échantillons, la communauté procaryote et eucaryote dominante au niveau du phylum partageait une similitude considérable dans la composition, mais pas dans l'abondance. La communauté procaryote dominante comprenait des Actinobacteria, Proteobacteria, Cyanobacteria, Planctomycetes, Verrucomicrobia, Bacteroidetes, Chlorobi, Chloroflexi, Firmicutes et Spirochaetes. Cercozoa, Chlororhyta, Arthropoda, Stramenopiles-non identifié, Fungi-non identifié, Prymnesiophyceae, Ciliophora, Mollusca, Choanomonada et Jakobida étaient les compositions dominantes des eucaryotes. De même, une différence significative existait au niveau du genre entre les 30 échantillons. Les résultats de la richesse et de la diversité ont montré que les microbes procaryotes et eucaryotes possédaient des compositions communautaires complexes dans 5 étangs. Bien que dans des périodes différentes et des étangs différents, la valeur des indices de Chao, Ace, Shannon et Simpson n'était pas significativement différente (P > 0,05).