Journal de la technologie microbienne et biochimique

Abstrait

Analyse communautaire des bactéries oxydant l'ammoniac par génétique moléculaire dans les boues activées des stations d'épuration des effluents

Député Shah

Nous avons étudié les communautés de bactéries oxydant l'ammoniac (AOB) dans les boues activées en utilisant la réaction en chaîne par polymérase (PCR) suivie du polymorphisme de longueur des fragments de restriction terminaux (T-RFLP), du clonage et du séquençage de la sous-unité alpha du gène de la monooxygénase de l'ammoniac (amoA). Dans cette étude, les techniques d'amplification spécifique des fragments d'ADNr 16S de l'oxydant de l'ammoniac par PCR, la séparation d'échantillons PCR mixtes par électrophorèse sur gel à gradient dénaturant (DGGE) et l'identification de bandes par hybridation spécifique avec des sondes oligonucléotidiques ont été combinées pour permettre la comparaison de la composition de la communauté de plusieurs échantillons dans l'espace et le temps. Les bandes DGGE d'intérêt ont également été excisées pour l'isolement de l'ADN, la réamplification, la détermination de la séquence et l'analyse phylogénétique. Nous avons comparé les échantillons mensuels du macrophyte émergent Glyceria maxima pour déterminer les effets saisonniers que les racines des plantes et la disponibilité en oxygène pourraient avoir sur les populations d'oxydants de l'ammoniac du sous-groupe β présentes. De même, cinq échantillons de sol ou de sédiments, présentant une disponibilité en oxygène variable et provenant de différents endroits, ont été comparés. Bien que la présence de deux groupes de séquences de Nitrosospira précédemment définis ait pu être détectée de manière différentielle dans les échantillons examinés, il n'y avait aucune preuve de l'existence d'un groupe particulier spécifique aux environnements périodiquement anoxiques.