Journal of Aquaculture Research & Development

Abstrait

Analyse comparative de la diversité génétique dans la population naturelle de Labeo rohita et de Cirrhinus marigala en utilisant des marqueurs moléculaires spécifiques à l'espèce

Faisal Tasleem*, Shahid M, Hina Fatima, Numan Gulzar M

Labeo rohita , communément appelé rohu et Cirrhinus marigala , communément appelé morakkha, sont les espèces de poissons les plus importantes et les plus cultivées sur le plan économique dans tout le sous-continent indien. L'évaluation génétique de ces espèces est nécessaire pour leur surveillance, leur conservation et leur production rentable. Différents types de marqueurs moléculaires sont disponibles, mais les SSR sont les plus importants en raison de leur répartition égale, de leur abondance dans le génome, de leur codominance, de leur polymorphisme, de leur détection à faible coût et de leur nature multi-allélique. Dans cette étude, dix échantillons de chaque espèce ont été collectés dans les régions de Head Punjnad, Head Muhammad Wala et Head Trimmu de la rivière Chenab, au Pakistan. Après l'extraction de l'ADN, l'amplification de cinq marqueurs de répétition de séquences simples, leur résolution sur PAGE et le score allélique pour les données génotypiques ont été utilisés pour l'analyse de différents indices de diversité génétique à l'aide de POPGENE version 1.32, FSTAT version 2.9.3.2, coefficient de similarité Jaccard et Dice, analyse de correspondance simple et programme SIMQUAL du package NTSYS-PC.

Français Dans le cas de Labeo rohita , un total de 26 allèles avec 260 loci ont été détectés, dont 189 se sont révélés polymorphes. Le polymorphisme des cinq marqueurs varie de 43,33 % à 96 %, avec une valeur moyenne de 72,69 %. La fréquence allélique varie de 0,2000 à 0,9000 avec une valeur moyenne de 0,4600, le nombre d'allèles varie de 4000 à 9000 avec une valeur moyenne de 5,2000, la diversité génétique varie de 0,1800 à 8800 avec une valeur moyenne de 0,6360 et la valeur PIC varie de 0,1638 à 0,8680 avec une valeur moyenne de 0,6012. La différence génétique par paire parmi les dix échantillons collectés varie de 0,400 à 0,900 tandis que la similarité génétique par paire varie de 0,100 à 1000. L'analyse de groupement basée sur l'UPGMA a divisé dix échantillons de Labeo rohita en trois groupes et trois sous-groupes. De même, cinq marqueurs SSR de Cirrhinus marigala montrent 30 allèles avec 300 loci sur dix échantillons avec 240 loci polymorphes. Le polymorphisme varie de 70 % à 96 %, avec une valeur moyenne de 80 %. La fréquence allélique varie de 0,4000 à 0,9000 avec une valeur moyenne de 0,6600. Le nombre d'allèles varie de 4 000 à 9 000 avec une valeur moyenne de 6 000. La diversité génétique varie de 0,1800 à 0,7800 avec une valeur moyenne de 0,4680. La valeur PIC varie de 0,1638 à 0,7578 avec une valeur moyenne de 0,4422. Les différences génétiques par paire entre dix échantillons de Cirrhinus marigala varient de 0,2000 à 0,800 et la similarité par paire varie de 0,200 à 1,000. L'analyse de groupement basée sur l'UPGMA a divisé tous les échantillons de Cirrhinus marigala en trois groupes et trois sous-groupes. Cette étude révèle que le gouvernement pakistanais et les organismes intéressés devraient prendre des mesures sérieuses pour améliorer la structure génétique de ces espèces, en particulier Cirrhinus marigala .