Comoé Koffi Donatien Benie, Adjéhi Dadié, David Coulibaly N'Golo, Nathalie Guessennd, Solange AKA, Koffi Marcellin DJE et Mireille Dosso
P. aeruginosa pourrait être impliqué dans l'intoxication alimentaire. Il est hautement pathogène pour les sujets immunodéprimés ou affaiblis, entraînant un taux élevé de morbidité et de mortalité. Le but de cette étude était de déterminer le marqueur phylogénétique adapté à l'identification moléculaire de Pseudomonas aeruginosa. La pureté et la concentration des acides nucléiques ont été déterminées par spectrophotométrie. Les réactions de sensibilité utilisant des marqueurs phylogénétiques (ARNr 16S, recA, rpoB, STS1) et le seuil de détection de 42 souches ont été évalués par réaction en chaîne par polymérase (PCR). Avec une absorption moyenne à 230 nm de 2,1, les extraits d'ADN présentent un rapport moyen (A260/A280) de 1,7. Français Le seuil de détection de la souche de référence ATCC 27853 de Pseudomonas aeruginosa était de 0,8 μg/ml pour rpoB et de 7,6 μg/ml pour chacun des marqueurs 16S ARNr et recA. Le seuil de détection des souches témoins positives CP2 : 1125A et CP3 : API était de 1,2 μg/ml et de 0,1 μg/ml pour l'utilisation du gène rpoB, respectivement. Ce seuil était respectivement de 12,3 μg/ml et de 0,9 μg/ml pour le gène recA. La sensibilité du gène de ménage rpoB était de 97,4 %, suivi par le gène recA et l'ARNr 16S avec 87,2 % et 82,1 %, respectivement. La résolution phylogénétique des gènes rpoB était supérieure à celle des gènes ARNr 16S et recA. Aucune réaction de sensibilité n'a été observée avec le marqueur ITS1. La qualité, la pureté des acides nucléiques et le choix du marqueur phylogénétique sont parmi les facteurs les plus critiques pour l'analyse PCR.