Journal of Pharmacogenomics & Pharmacoproteomics

Abstrait

Répartition interethnique des génotypes et haplotypes Cyp2c19 cliniquement pertinents

Narazah Mohd Yusoff*, Mohamed Saleem, Devaki Nagaya, Badrul Hisham Yahaya, Rasmaizatul Akma Rosdi, Nurfadhlina Moosa, Rusli Ismail et Tan Soo Choon

Contexte de l'étude : La connaissance du phénotype métabolique d'un patient est essentielle pour faire un choix éclairé concernant la prescription de médicaments thérapeutiques. L'objectif de cette étude était de déterminer la prévalence des variantes cliniques courantes du gène CYP2C19 dans les groupes ethniques malaisiens et dans d'autres populations asiatiques et moyen-orientales, et de prédire leurs phénotypes métaboliques.

Méthodes : Un total de 1103 sujets issus de six origines ancestrales ont été génotypés pour 16 marqueurs polymorphes d'un seul nucléotide (SNP) sur le gène CYP2C19 afin de comprendre de manière exhaustive leurs distributions alléliques. L'algorithme expectationmaximisation a été utilisé pour analyser les données génotypiques afin d'estimer les haplotypes de vraisemblance maximale dans chaque groupe d'échantillons et de prédire les phénogroupes cliniques.

Résultats : Sur les 16 loci SNP génotypés dans les six sous-populations étudiées, seuls quatre marqueurs SNP (rs17885098, rs4986893, rs4244285 et rs3758581) présentaient un polymorphisme (fréquence d'allèle mineur > 1,0 %). Près de la moitié des Indiens (55 %) et des Chinois (48,8 %) avaient au moins une copie de l'allèle de perte de fonction. L'incidence était relativement plus faible chez les Malais (39,3 %), les Orang Asli (27,3 %), les Javanais (23,8 %) et les Saoudiens (28 %).

Conclusion : Ces groupes ethniques présentent un risque important de sensibilité aux médicaments s’ils se voient prescrire des doses régulières de substrat du CYP2C19.