Journal de génie chimique avancé

Abstrait

Données cristallographiques et qualité du modèle – Au-delà de 0,8 Å et modèle atomique indépendant

Maura Malinska

Français Généralement, le modèle atomique indépendant (IAM) de la densité électronique est utilisé dans le cas de l'analyse de routine des données de rayons X. Cependant, ce modèle ne donne pas une description quantitative de la distribution de la densité électronique car les atomes sont supposés neutres et sphériques. L'objectif du projet est d'utiliser de nouvelles méthodes qui ont été développées pour la reconstruction de la densité électronique par rapport aux données de diffraction des rayons X CuKα. Ces méthodes sont le modèle de densité de déformation orientée par liaison (BODD). Notre étude a montré une concordance entre les résultats après affinements par rapport aux données MoKα et CuKα. Les erreurs systématiques observées pour les données CuKα sont ; des ADP systématiquement plus élevés des atomes lourds et moins d'informations sur la densité dans les cartes de densité résiduelle et les tracés de dimension fractale. Cela découle de la quantité d'informations disponibles dans les données CuKα. Sans aucun doute, l'utilisation des méthodes décrites donne des structures finales plus précises et plus exactes par rapport à la structure IAM. Comme prévu, les méthodes HAR et TAAM sont plus précises et plus exactes que le BODD, tandis que le BODD est plus rapide et plus convivial. Les résultats de HAR et TAAM sont similaires, cependant, pour le raffinement de HAR, nous recommandons d'estimer les ADP des atomes d'hydrogène à l'aide du serveur SHADE.