Journal de la technologie microbienne et biochimique

Abstrait

Décrypter les communautés microbiennes complexes du sol grâce à la nouvelle approche « omique »

Girish R Nair et Suresh SS Raja

L'omique utilise une suite de techniques à haut débit couplées à une analyse informatique robuste pour extraire tous les aspects de l'information des communautés microbiennes, donnant ainsi accès à leur génome, métagénome, transcriptome, protéome et métabolome. Au cours des 5 à 10 dernières années, l'omique a révolutionné le domaine de l'écologie et de la diversité microbiennes en surmontant plusieurs défis associés à l'isolement et à la caractérisation de micro-organismes inconnus provenant de différents environnements. Avec les progrès technologiques croissants, l'omique se développe rapidement en incorporant de nouveaux domaines d'étude comme la métabolomique et la culturomique et pourrait être qualifiée d'omique du nouvel âge. Le package omique du nouvel âge implique des techniques de détection et d'analyse inégalées qui pourraient être utilisées pour étudier le microbiote du sol, ce qui était autrefois considéré comme une tâche difficile. La présente revue résume les découvertes scientifiques chronologiques qui ont contribué à l'étude des micro-organismes du sol et familiarise avec les méthodologies omiques et son importance dans l'écologie microbienne du sol.