Journal de pathologie végétale et de microbiologie

Abstrait

Détection, identification et quantification de Fusarium graminearum et Fusarium culmorum dans les grains de blé par techniques PCR

Rabab Sanoubar, Astrid Bauer et Luitgardis Seigner

Cette étude a été réalisée sur 172 échantillons de blé d'hiver. Les échantillons étaient constitués de divers cultivars prélevés au hasard dans les champs d'agriculteurs de différentes régions de Bavière, dans le sud de l'Allemagne. Les objectifs de cette étude étaient de détecter la présence du gène Tri-5 producteur de champignons qui génère des mycotoxines trichothécènes , en particulier le déoxynivalénol (DON), en utilisant la PCR qualitative conventionnelle ; de déterminer la corrélation entre la présence du gène Tri-5 et la teneur en DON ; d'évaluer l'infection par Fusarium graminearum et Fusarium culmorum par PCR en temps réel et d'estimer la corrélation entre la teneur en DON et la gravité de la contamination par F. graminearum et F. culmorum. Cette étude a montré que 86 % de tous les échantillons infectés avaient un gène Tri-5 et amplifiaient un seul fragment de 544 pb associé à une quantité détectable de DON (allant de 10 à 2990 μg kg-1). Cette étude a démontré que F. graminearum est l'espèce prédominante associée à la fusariose de l'épi (FHB) et a été considérée comme le producteur prédominant de trichothécènes associé à la FHB puisqu'il y avait une corrélation hautement significative (R2 = 0,7) entre le DON et la teneur en ADN de F. graminearum , par rapport à une faible corrélation (R2 = 0,03) entre le DON et la teneur en ADN des grains de blé infectés par F. culmorum.