Journal de bactériologie et parasitologie

Abstrait

Détection, identification et test de sensibilité des bactéries par cytométrie de flux

Sabine Nuding et Lutz T Zabel

La cytométrie de flux permet l'analyse simultanée de nombreux paramètres des cellules eucaryotes ainsi que des micro-organismes, ce qui en fait un outil puissant pour la différenciation et l'analyse fonctionnelle. Cependant, l'application de la cytométrie de flux en microbiologie clinique est encore peu fréquente. Nous rapportons ici le développement de tests de cytométrie de flux pour détecter et identifier les bactéries et déterminer la sensibilité aux antibiotiques. Les tests de sensibilité d'un large spectre d'isolats de cultures bactériennes étaient basés sur l'oxonol DiBAC4(3), et modifiés pour permettre des tests de sensibilité à l'aide d'échantillons tels que des hémocultures ou des écouvillons. De plus, un test étendu a été développé pour la détection rapide de
Staphylococcus aureus résistant à la méthicilline (SARM) dans les 6 heures à partir d'écouvillons. Les résultats de 402 tests de sensibilité par cytométrie de flux ont été confirmés par diffusion sur disque d'agar Bauer-Kirby ou par des systèmes automatisés avec une concordance moyenne de 94 %. Ce test a permis un gain de temps essentiel d'une journée, en particulier concernant les bactéries productrices de bêta-lactamases étendues (BLSE). Les tests de sensibilité réalisés directement à partir d'hémocultures positives ou d'écouvillons ont également augmenté la rapidité. Les résultats de sensibilité des souches bactériennes testées directement à partir d'hémocultures ont atteint une concordance de 89 % par rapport à Vitek® 2. Après examen de 140 écouvillons de dépistage de patients colonisés par le SARM et de leurs personnes en contact,
22 écouvillons ont été identifiés correctement comme contenant du SARM, 2 échantillons de SARM n'ont pas été identifiés en raison d'un manque d'expression de la protéine A des souches de SARM. Aucune fausse classification comme écouvillons positifs au SARM n'a eu lieu. La cytométrie de flux offre une technique appropriée pour la détection, l'identification et le test de sensibilité rapides des bactéries à fort potentiel.