Technologie génétique

Abstrait

Détection de la 5-carboxylcytosine dans l'ADN des cellules de mammifères

Yihua Gao, Jian Li, Bin Chen, Qingjin Yang, Junjie Zhang, Lijian Zhang, Qionglin Huang, Xiaoxia Ye et Chun Cai

La 5-carboxylcytosine (5caC) est un dérivé important de la modification de la cytosine dans la voie de déméthylation de l'ADN. Cependant, la quantification précise de la 5caC est un défi, en particulier dans les tissus des mammifères. Cette situation résulte probablement de la quantité infime de 5caC dans les mammifères et de la sensibilité inadéquate des technologies existantes. Nous rapportons ici une nouvelle méthode LC-MS/MS pour quantifier précisément la 5caC dans les cellules de mammifères. Le réactif standard 5caC a été synthétisé, et l'ADN génomique a été hydrolysé avec de l'acide formique et le composé cible 5caC a été détecté par HILIC LC-MS/MS. Les résultats ont montré que la 5caC existe généralement dans les organes et les tissus cancéreux des souris. La teneur en 5caC dans le cerveau des souris était plus élevée que dans les poumons et le foie, et était évidemment diminuée dans les tissus cancéreux colorectaux par rapport aux tissus adjacents. Ce résultat suggère que la 5caC est probablement associée à la tumorigenèse et joue un rôle dominant dans le contrôle épigénétique de la fonction neuronale.