Journal de pathologie végétale et de microbiologie

Abstrait

Détection du gène de la protéine de coque du virus de l'enroulement de la pomme de terre par amplification isotherme médiée par une boucle de transcription inverse

Mohammad Amin Almasi, Hossein Jafary, Aboubakr Moradi, Neda Zand, Mehdi Aghapour Ojaghkandi et Saeedeh Aghaei

Le test d'amplification isotherme à médiation par boucle amplifie l'ADN/ARN avec une spécificité et une sensibilité élevées. Dans cette étude, nous décrivons un test LAMP optimisé de transcription inverse pour la détection du virus de l'enroulement de la pomme de terre. Tout d'abord, un test DAS-ELISA a été réalisé pour détecter le virus dans une collection contenant 40 échantillons suspects. Enfin, deux échantillons ont été détectés comme étant les échantillons positifs. Ensuite, les échantillons positifs ont été vérifiés par les méthodes RT-PCR et RT-LAMP. De plus, les résultats ont démontré que le test RT-LAMP était 40 fois plus sensible et 4 fois plus rapide que le RT-PCR. Le test RT-LAMP a été réalisé dans un bain-marie, soit sans machine à cycle thermique, soit dans des installations de laboratoire sophistiquées. De plus, dans la réaction RT-LAMP, les échantillons positifs ont été détectés grâce à la turbidité produite par le pyrophosphate de magnésium. Il est intéressant de noter que l'application de CaCl2 au lieu de
MgSO4 qui crée du pyrophosphate de calcium en réaction pourrait augmenter considérablement la stabilité et la concentration de la turbidité. Par conséquent, il pourrait s'agir d'une alternative intéressante au MgSO4. Dans l'ensemble, le test RT-LAMP récemment développé peut être une méthode sensible, spécifique et peu coûteuse pour la détection précoce du virus de l'enroulement de la pomme de terre et d'autres agents pathogènes viraux des plantes.