Journal de pathologie végétale et de microbiologie

Abstrait

Détection de Fusarium oxysporum f. sp. elaeidis responsable de la fusariose du palmier à huile à l'aide de l'amplification isotherme à médiation par boucle (LAMP)

Kwasi Adusei-Fosu et Matthew Dickinson

Fusarium oxysporum f. sp. elaeidis (FOE), un agent pathogène responsable de la fusariose du palmier à huile, peut être détecté par réaction en chaîne par polymérase (PCR), mais cela prend beaucoup de temps. L'amplification isotherme à médiation par boucle (LAMP) a été utilisée pour détecter rapidement Fusarium oxysporum f. sp. elaeidis (FOE) dans les semis de palmiers à huile. Huit isolats supplémentaires de Fusarium oxysporum prélevés sur des palmiers à huile symptomatiques (c'est-à-dire présumés FOE car leur pathogénicité n'a pas été confirmée) et cinq autres isolats non FOE ont été échantillonnés respectivement sur des palmiers à huile matures symptomatiques et sur des tomates afin d'élargir la portée de la recherche. Les identités de FOE, présumé FOE et non FOE ont été établies par séquençage. Les amorces LAMP conçues pour détecter FOE ou présumé FOE étaient basées sur des séquences partielles de sécrété dans le xylème (SIX8) et du cytochrome P-450. Le temps de détection le plus précoce pour les amorces du cytochrome SIX8 et P-450 était respectivement de 4:00 min et 6:45 min, les deux enregistrant un temps de détection tardif à 26:30 min. Des courbes dérivées de recuit ont été utilisées pour évaluer le niveau de spécificité pour les deux cytochromes SIX8 et P-450, mais aucune des amorces LAMP n'a pu faire la distinction entre FOE, FOE présumé et non-FOE.