Journal de pathologie végétale et de microbiologie

Abstrait

Détection des pectobacterium agents responsables de la pourriture molle de la pomme de terre dans les provinces du nord-ouest de l'Iran

Sima Azadmanesh, Alireza Marefat et Kayhan Azadmanesh

Diverses bactéries appartenant à la famille des Enterobacteriaceae sont connues pour être des agents responsables de la jambe noire et de la pourriture molle de la pomme de terre. Dans cette étude, une méthode de détection rapide et spécifique a été utilisée pour étudier les bactéries dans certaines provinces du nord-ouest de l'Iran (Zanjan, Kordestan et Azerbaïdjan oriental). 26 souches ont été sélectionnées pour l'étude qui avaient été identifiées dans des études précédentes comme des pathogènes représentatifs, à savoir : 14 Pectobactrium carotovorum subsp carotovorum, 7 Dickeya chrysanthemi et 5 Pectobactrium atrosepticum. Les amorces Y1/Y2, Expccf/r, ADE1/2 et Eca1f/r, publiées comme amorces spécifiques pour les pathogènes, ont été testées pour déterminer si elles pouvaient être utilisées pour l'amplification spécifique de l'ADN dans les souches. Le fragment spécifique attendu n'a pas été amplifié dans de nombreuses souches ou dans plusieurs bandes non spécifiques, certaines proches de ces fragments attendus ont été amplifiées. Des amorces spécifiques pour l'amplification de l'ADN des agents pathogènes ont été conçues en séquençant la région ITS à partir de souches représentatives et un test PCR
a été développé. Dans le test PCR, un fragment de 300 pb a été amplifié à partir de toutes les souches collectées dans les provinces. Dans les tests de spécificité, aucun produit PCR n'a été obtenu à partir d'autres bactéries appartenant à d'autres genres.