Journal de pathologie végétale et de microbiologie

Abstrait

Développement d'une méthode RT-PCR en temps réel pour la détection et la quantification rapides du virus du nain strié noir du riz du Sud

Songbai Zhang, Deyong Zhang, Yong Liu, Xiangwen Luo, Jue Cheng et Jing Peng

Le virus du nain strié noir du riz du sud (SRBSDV) est une nouvelle espèce de pathogène du groupe 2 du genre Fijivirus , qui a causé de graves pertes de rendement dans de nombreuses cultures céréalières importantes, telles que le riz et le maïs, au cours des quatre dernières années (2008-2011), importées de Chine et d'Asie du Sud-Est. Il convient de noter qu'il n'y a pas de symptômes typiques chez les riz infectés au début, ce qui peut éviter de graves pertes de rendement. Il est donc très important de détecter le stade précoce de l'infection du SRBSDV dans le riz. À cette fin, une méthode de RT-PCR en temps réel a été établie et utilisée pour détecter ce virus dans des échantillons de riz, et elle a également été comparée à la RT-PCR conventionnelle. Français Les résultats ont montré que la RT-PCR en temps réel possédait une spécificité et une sensibilité élevées pour la détection du SRBSDV, et la relation entre les valeurs Ct et le nombre de copies de SRBSDV était linéaire avec une plage de 4,04 × 10 ² -4,04 × 10 ⁷ copies/réaction, et la sensibilité atteignait 150 copies/réaction. La variabilité intra- et inter-essais était faible. La RT-PCR en temps réel a détecté le SRBSDV dans 87,5 % à 100 % des échantillons de riz de champ, contre 63,6 % à 100 % par RT-PCR classique. Dans l'ensemble, la RT-PCR en temps réel est une méthode alternative intéressante pour détecter le SRBSDV dans le riz.