Journal de pathologie végétale et de microbiologie

Abstrait

Développement d'un test d'amplification isotherme à médiation par boucle colorimétrique pour la détection rapide du virus de la feuille jaune en cuillère de la tomate

Mohammad Amin Almasi, Mehdi Aghapour Ojaghkandi, Ahmad Hemmabatadi, Fatah Hamidi et Saeedeh Aghaei

L'amplification isotherme à médiation par boucle (LAMP) est une nouvelle technique d'amplification de l'ADN à température constante, avec une spécificité, une sensibilité, une rapidité et une efficacité élevées. Nous avons appliqué pour la première fois un protocole de détection rapide qui utilise l'amplification isotherme à médiation par boucle colorimétrique pour la détection du virus de la tomate en frisure des feuilles jaunes. À cet égard, les quatre amorces LAMP (c'est-à-dire F3, B3, FIP et BIP) ainsi que les amorces PCR (F et R) ont été conçues sur la base du gène SF des séquences d'ADN du TYLCV. Même si les tests DAS-ELISA, PCR et LAMP pouvaient détecter avec succès des échantillons infectés positifs, compte tenu du temps, de la sécurité, de la sensibilité, du coût et de la simplicité, le dernier était globalement supérieur. Parallèlement, parmi les cinq colorants visuels différents permettant de détecter avec précision les produits LAMP, le bleu d'hydroxynaphtol et GeneFinderTM pouvaient produire un changement de couleur et une luminosité stables et durables dans une approche en tube fermé pour éviter le risque de contamination croisée, et se sont finalement révélés être les meilleurs. Dans l’ensemble, les résultats ont montré que le LAMP offre un format d’analyse nouveau et pratique intéressant pour l’
outil de diagnostic rapide, sensible, rentable et assez convivial de reconnaissance du virus de la cloque des feuilles jaunes de la tomate et présente donc une alternative aux analyses basées sur la PCR.