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Abstrait

Développement d'une méthode moléculaire pour la détection spécifique des espèces de Begomovirus responsables de la frisure des feuilles de tomate aux Philippines

Jérémy Roy Augustus I Gomez*

La tomate est l'une des cultures légumières les plus importantes en raison de sa valeur économique et nutritionnelle, mais en raison d'une maladie causée par un Begomovirus , la production de tomates a diminué au fil des ans. Les Begomovirus responsables de la frisure jaune des feuilles de tomate ou de la frisure des feuilles de tomate affectent la production de tomates dans de nombreuses régions tropicales et subtropicales du monde. La détection limitée de ces virus végétaux les rend si difficiles à détecter et à contrôler. L'étude vise à développer une méthode moléculaire pour la détection spécifique de ToLCPV et ToLCCeV. Cela a été fait en : 1) Validant si les amorces publiées pouvaient s'hybrider à une espèce spécifique de Begomovirus en utilisant l'alignement de séquences multiples, 2) Concevant des amorces pour la détection spécifique de ToLCPV ou ToLCCeV et optimisées par PCR, 3) Validant l'amorce conçue pour la détection spécifique de ToLCPV et ToLCCeV en utilisant des échantillons collectés sur le terrain, 4) Identifiant le modèle RFLP en utilisant l'ADN génomique complet in silico . Français Les amorces publiées ont pu s'hybrider aux souches ToLCPV et aux espèces ToLCCeV, ToLCMiV et ces amorces doivent donc être validées dans une expérience réelle pour déterminer leur spécificité. Les amorces ToLCPV19 et ToLCCeV19 ont été conçues pour détecter spécifiquement les espèces ToLCPV et ToLCCeV respectivement et la PCR a été optimisée pour différentes températures d'hybridation : 53℃, 55℃ et 57℃. Des amplicons d'environ 200 pb ont été observés sur des échantillons de tomates infectés par ToLCPV et également sur des échantillons de tomates infectés par ToLCCeV lors de l'utilisation des amorces ToLCPV19 et ToLCCeV19. De plus, il n'y avait aucune différence dans la taille de la bande et l'intensité des bandes à différentes températures d'hybridation. La validation des amorces conçues a été effectuée, mais sur seulement quelques échantillons de tomates sélectionnés et une validation supplémentaire doit donc être effectuée pour déterminer la spécificité des amorces conçues. L'analyse RFLP a montré que l'enzyme de restriction EcoRI pouvait distinguer ToLCPV, ToLCCeV et ToLCMiV car elle produisait un nombre différent de bandes par espèce de Begomovirus .

Avertissement: Ce résumé a été traduit à l'aide d'outils d'intelligence artificielle et n'a pas encore été examiné ni vérifié