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Abstrait
Développement d'une PCR multiplex pour la détection spécifique de Xanthomonas campestris pv. campestris dans le chou et corrélation avec l'incidence de la maladie
RK Roohie et S Umesha
La pourriture noire, la maladie la plus grave des crucifères, en particulier de Brassica oleracea var. capitata (chou), provoque d'énormes pertes de rendement. La pourriture noire est une maladie transmise par les semences et l'évaluation des semences pour l'agent pathogène est très cruciale. Les semences de chou ont été testées pour l'infection par X. campestris pv. campestris par analyse biochimique et PCR. Les échantillons de semences ont été soumis à une analyse PCR avec trois amorces, dont l'une des paires d'amorces spécifiques du gène hrpF pouvait détecter l'agent pathogène de la pourriture noire. L'étude actuelle est la première du genre dans laquelle les cultivars de chou disponibles localement ont été évalués à l'aide d'essais moléculaires et les cultivars largement cultivés dans la zone d'étude ont été vérifiés pour la corrélation entre les performances en laboratoire et sur le terrain. L'objectif de l'étude était d'utiliser les procédures spécifiques et sensibles basées sur la PCR disponibles pour la détection de routine de X. campestris pv. campestris dans les semences de chou. La PCR multiplex a été standardisée pour la détection simultanée de l'agent pathogène et des espèces de Brassica, de l'espaceur interne transcrit (ITS) dans les semences et les feuilles infectées. Les empreintes de PCR multiplex ont été obtenues, amplifiant un fragment de 619 pb du gène hrpF de X. campestris pv. campestris et une section de 360 pb de la région d'espacement interne transcrite de Brassica sp. Le test a également facilement détecté les infections par X. campestris pv. campestris dans les plantes malades et à partir de colonies bactériennes isolées sur des milieux sélectifs, et s'est avéré plus sensible et spécifique que les méthodes de mise en culture traditionnelles. Ainsi, grâce à l'utilisation de la PCR multiplex, il a été possible de déterminer le niveau seuil de détection bactérienne dans les graines de chou.