Journal de pathologie végétale et de microbiologie

Abstrait

Développement d'une méthode de diagnostic simple et rapide du virus de la tache annulaire latente du fraisier dans les plantes à l'aide d'un test d'amplification isotherme à médiation par boucle

Jin-Ho Kim, Siwon Lee, Ji-Young Choi, Sue Kyung Kim et Won-Cheoul Jang

Le virus des taches annulaires latentes du fraisier (SLRSV) est un virus transmis par les semences ou les nématodes et provoque des pertes quantitatives et qualitatives de diverses cultures. Le SLRSV est un virus non signalé, potentiellement contrôlable, qui est géré au niveau national. Actuellement, la RT-PCR et le système de PCR imbriquée sont les méthodes standard de détection du SLRSV, mais des méthodes plus efficaces sont nécessaires. Dans cette étude, le test d' amplification isotherme à médiation par boucle (LAMP) a été utilisé pour la détection du SLRSV. En conséquence, le test LAMP a montré une sensibilité similaire à celle de la méthode actuellement utilisée, mais il est plus rapide (environ 8 heures), simple et spécifique. De plus, les résultats peuvent être vérifiés par polymorphisme de longueur des fragments de restriction (RFLP) en utilisant BfaI, ou par séquençage après la réaction LAMP. Par conséquent, nous avons montré que le test LAMP développé dans cette étude est un marqueur potentiel pour faciliter le dépistage rapide et simple du SLRSV dans les plantes, ce qui sera finalement utile pour le diagnostic des plantes infectées par le SLRSV et la quarantaine.