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Abstrait
Analyse d'affichage différentiel de l'ADNc impliqué dans la réponse des tapis microbiens après une contamination par du fioul lourd
Sylvain Bordenave, Marisol Goni-Urriza, Pierre Caumette et Robert Duran
Des tapis microbiens intacts provenant de marais salants de Camargue (France) maintenus en microcosme ont été contaminés par du fioul lourd Erika afin d'identifier les séquences de gènes induits en réponse à une contamination par du fioul lourd. L'approche de détection différentielle a été adaptée pour détecter des ARNm exprimés différemment dans des communautés bactériennes complexes. Parmi les six fragments d'ADNc différentiellement exprimés (DD) isolés, un a été identifié et associé à une pompe d'efflux de type ABC. Un deuxième fragment DD était lié à une protéine hypothétique conservée trouvée dans de nombreuses espèces bactériennes différentes. Bien que les fragments différentiellement exprimés n'étaient pas pu être clairement identifiés, cette étude ouvre de nouvelles perspectives pour l'amélioration de nos connaissances sur la réponse de la communauté microbienne après une contamination par du pétrole.