Journal des maladies tropicales et de la santé publique

Abstrait

Différenciation des oiseaux aquatiques humains et migrateurs par la technique d'amplification différentielle multiplex d'Escherichia coli (MECDAT) dans le sud du Pendjab, au Pakistan

Sahar Kiran, Alia Waheed, Aleem Ahmad Khan, Mubashar Aziz, Muhammad Mazhar Ayaz et Ahsan Sattar Sheikh

Escherichia coli , une bactérie Gram négatif, anaérobie facultative, non sporulante, est communément présente dans l'intestin grêle et fait partie de la flore intestinale normale de tous les organismes à sang chaud. La plupart des souches d'E. coli ont de nombreuses fonctions bénéfiques, notamment la protection contre d'autres bactéries pathogènes. Lorsque les souches d'E. coli acquièrent du matériel génétique d'autres bactéries, elles peuvent devenir pathogènes. Les souches d'E. coli peuvent être classées en 5 principaux groupes de pathogénicité : E. coli entéropathogène (EPEC), E. coli entéroagrégatif (EAEC), E. coli entéroinvasif (EIEC), E. coli entérotoxogène (ETEC) et E. coli entérohémorragique (EHEC). Toutes ces souches peuvent provoquer des diarrhées, des infections gastro-intestinales, des infections des voies urinaires, des méningites néonatales et d'autres maladies chez l'homme ainsi que chez l'animal. L'EHEC O157 est facilement identifié en laboratoire clinique à l'aide de techniques de culture standard. Toutes les autres souches nécessitent des méthodes moléculaires pour leur présence dans tout matériel infecté. Dans cette étude, nous avons isolé un total de 40 cultures et détecté différentes souches d' E. coli chez les humains et les oiseaux (oiseaux aquatiques). Dans tous les isolats, la sensibilité aux antibiotiques par la méthode de diffusion sur disque avec caractérisation génétique au sein de l' E. coli . Le résultat montre que tous les E. coli humains étaient résistants à 3 antibiotiques (ampicilline, cotrimoxazole et céfuroxime), tandis que les souches d'E. coli aviaires sont sensibles à ces antibiotiques, ce qui indique une lignée génomique différente. Dans les isolats humains, l'EHEC a la part la plus élevée, mais elle n'était pas placée de manière significative. Dans les études de corrélation (corrélation de Pearson), cela indique que son importance pour l'utilisation du seul chloramphénicol (p = 0,044). L'ANOVA ainsi que les coefficients de Pearson et de Spearman montrent qu'il n'y a aucune association avec l'un des médicaments qui pourraient être utiles pour leur traitement. On pourrait conclure à partir du profil antibiotique, du modèle de distribution que les deux groupes sont épidémiologiquement différents. De plus, il semble que les oiseaux ne contribuent pas à la propagation de maladies chez les humains/animaux.