Oliver Kaut, Amit Sharma, Ullrich Wüllner
L'empreinte génomique est un phénomène épigénétique qui entraîne une expression différentielle des allèles en fonction de leur origine parentale. L'importance fonctionnelle de la méthylation de l'ADN dans l'empreinte génomique a été largement étudiée et à ce jour, environ 100 gènes imprimés ont été identifiés chez l'homme. Pour déterminer si le statut de méthylation de ces gènes d'empreinte « connus » est associé à la maladie de Parkinson (MP), nous avons analysé le profil de méthylation de tous ces gènes d'empreinte « connus » en utilisant une approche à l'échelle de l'épigénome avec la puce de méthylation 450K d'Illumina. Il est frappant de constater qu'aucun de ces gènes annotés autosomiques totaux ne présente de changements de méthylation de l'ADN entre les personnes atteintes de MP et les individus sains. Nous avons affiné notre analyse en évaluant la méthylation de l'ADN pour le gène humain imprimé par la mère codant pour le facteur de croissance analogue à l'insuline 2 (IGF2) en utilisant la PCR de séquençage au bisulfite (BSP) et en considérant différents dosages de L-dopa. Nos résultats démontrent que les profils de méthylation spécifiquement dans la région génomique de l'exon 8-9 du gène IGF2 dans la MP ne sont pas influencés par le dosage du traitement par L-dopa ni par la maladie elle-même. Ainsi, la perte ou la perturbation de l'empreinte dans les chromosomes autosomiques ne semble pas apparente dans la MP et n'est pas pertinente pour la pathogénèse de la maladie.