Journal des troubles sanguins et de la transfusion

Abstrait

Analyse moléculaire d'amarrage du médicament potentiel Paritaprevir contre Mycobacterium tuberculosis (Mtb)

Ivan Vito Ferrari*, Paolo Patrizio

Mycobacterium tuberculosis (Mtb) est l'agent causal de la tuberculose, qui tue 1,8 million de personnes chaque année. Il s'agit d'une maladie infectieuse qui affecte généralement les poumons, mais peut également affecter d'autres parties du corps. L'ARN polymérase de Mtb (RNAP) est la cible du médicament antituberculeux de première intention, la rifampicine (Rif). Nous rapportons pour la première fois un médicament potentiel, le paritaprévir, contre une maladie infectieuse grave, par une approche in silico , en utilisant Auto dock Vina et Auto dock 4 (ou MGL Tool), estimé avec Pyrx et AM Dock Software, en calculant trois paramètres importants différents : l'affinité de liaison (kcal/mol), le Ki estimé (en unités nM) et l'efficacité du ligand (LE en kcal/mol). Français Après une analyse sélective de plus de 1000 médicaments, traités avec Pyrx (un logiciel de criblage virtuel pour la découverte informatique de médicaments) dans la poche du site de liaison du ligand de la protéine (ID PDB 5UHB chaîne C, sous-unité bêta de l'ARN polymérase dirigée par l'ADN), nous avons remarqué des valeurs élevées de ces 3 paramètres mentionnés ci-dessus du Paritaprevir, concluant qu'il pourrait être un excellent médicament candidat pour ce type d'infection. En effet, d'après les résultats d'Auto dock Vina et d'Auto dock 4 (ou Auto dock 4.2), mis en œuvre avec l'algorithme génétique lamarckien, LGA, via le logiciel AM Dock, ce médicament oral, approuvé par la FDA en 2014, à la fois par Auto dock Vina et Auto dock Vina 4 a une excellente valeur d'affinité de liaison, environ -10,00 kcal/mol, une valeur Ki 40 nM et une efficacité du ligand environ -0,15 kcal/mol. Ces résultats sont comparables au médicament cristallisé dans la protéine mentionnée ci-dessus, actuellement utilisé contre la TBC.