Journal of Astrobiology & Outreach

Abstrait

Le CRISPR/Cas nous aide-t-il à comprendre l'écologie microbienne dans l'espace ? : Échantillons de Thermococcus spp.

Özge Kahraman-Ilıkkan

Dans cette recherche, les régions CRISPR/Cas de 27 séquences génomiques complètes d'archées hyperthermophiles, Thermocococcus spp. ont été examinées. Les séquences d'espaceurs obtenues à partir des systèmes CRISPR/Cas ont été criblées et des envahisseurs plasmidiques ou phagiques ont été détectés. Les cheminées hydrothermales présentent une diversité microbienne et une composition chimique énormes. Les cheminées des grands fonds marins sont donc des emplacements très critiques pour étudier et observer l'environnement et l'évolution de la Terre primitive. Par conséquent, des bases de données d'espaceurs dérivées des systèmes CRISPR (clustered regularly interspaced short palindromic repeat) ont été utilisées pour voir si ce système peut être utilisé pour deviner les interactions écologiques entre les archées et les virus ou les plasmides. On pense que ces cheminées hydrothermales se trouvent dans d'autres mondes océaniques tels qu'Europe et Encelade. Par conséquent, les astrobiologistes se sont beaucoup intéressés à ces lunes et les chercheurs se sont demandé si ces systèmes pouvaient être la preuve de l'existence d'extrémophiles. En conclusion, le système CRISPR/Cas a été considéré comme une étape supplémentaire dans l'observation de la diversité écologique dans les systèmes extraterrestres, en particulier ceux qui sont supposés avoir des sources hydrothermales comme Europe ou Encelade.