Génétique héréditaire : recherche actuelle

Abstrait

Indicateurs épigénomiques de l'âge chez les Afro-Américains

Jennifer A. Smith, Alicia L. Zagel, Yan V. Sun, Dana C. Dolinoy, Lawrence F. Bielak, Patricia A. Peyser, Stephen T. Turner, Thomas H. Mosley Jr. et Sharon L.R. Kardia

L'âge est un facteur de risque bien établi pour les maladies chroniques. Cependant, les changements cellulaires et moléculaires associés aux processus de vieillissement qui sont liés à l'initiation et à la progression des maladies chroniques ne sont pas bien compris. Ainsi, il est de plus en plus nécessaire d'identifier de nouveaux marqueurs des changements cellulaires et moléculaires qui se produisent au cours des processus de vieillissement. Dans cette étude, nous utilisons la méthylation de l'ADN à l'échelle du génome à partir de 26 428 sites CpG dans 13 877 gènes pour étudier la relation entre l'âge et la variation épigénétique dans les cellules sanguines périphériques de 972 adultes afro-américains de l'étude Genetic Epidemiology Network of Arteriopathy (GENOA) (âge moyen = 66,3 ans, intervalle = 39-95). L'âge était significativement associé à 7 601 (28,8 %) sites CpG après correction de Bonferroni pour α = 0,05 (p < 1,89 × 10-6). En raison des associations extraordinairement fortes entre l'âge et de nombreux sites CpG (> 7 000 sites avec des valeurs de p allant de 10-6 à 10-43), nous avons étudié dans quelle mesure les marqueurs de méthylation de l'ADN prédisent l'âge. Nous avons constaté que 2 095 sites CpG (7,9 %) étaient des prédicteurs significatifs de l'âge après correction de Bonferroni. Les cinq principaux composants des 2 095 sites CpG associés à l'âge représentaient 69,3 % de la variabilité de ces sites CpG et expliquaient 26,8 % de la variation de l'âge. Les associations entre les marqueurs de méthylation et l'âge adulte sont si omniprésentes et si fortes que nous émettons l'hypothèse que les schémas de méthylation de l'ADN peuvent être une mesure importante des processus de vieillissement cellulaire. Étant donné la nature hautement corrélée de l'épigénome associé à l'âge (comme le prouve l'analyse des composantes principales), des voies entières peuvent être régulées en conséquence du vieillissement.