Agrotechnologie

Abstrait

Évaluation de la diversité génétique de l'igname aérienne ( Dioscorea bulbifera L) à l'aide de marqueurs de répétitions de séquences simples (SSR)

Aniefiok Ndubuisi Osuagwu, Edem UL

Dioscorea bulbifera est une plante cultivée sous-utilisée de la famille des Dioscoreacea, largement répandue dans les régions tropicales et subsahariennes d'Afrique de l'Ouest. Vingt-cinq accessions de D. bulbifera d'Afrique de l'Ouest conservées dans la banque de matériel génétique de l'Institut international d'agriculture tropicale (IITA) ont été criblées pour la diversité génétique en utilisant dix loci microsatellites dans un volume de réaction de 25 ul dans une plaque de microtitrage à 96 puits. Le mélange réactionnel était composé de 3 µ l d'ADN matrice à 10 ng/ µ l, 2 µ l de DNTP à 2,5 mM, 1 µ l de MgCl ₂ à 2,5 mM , 1 µ chacun d'amorces directes et inverses, 1 µ l de DMSO ₄ , 0,1 µ l d'ADN polymérase Taq à 5 µ g/ µ l (Invitrogen) et 3 µ l d'ADN à 10 ng/ µ l. Le volume total de réaction a été porté à 25 volumes en utilisant 13,4 µl d'eau exempte de nucléase. Le programme de PCR comprenait une dénaturation à 94°C pendant 30 secondes, suivie de 35 cycles de 94°C pendant 30 secondes, 55 ou 45°C pendant 20 secondes et 72°C pendant 30 secondes, avec une étape d'extension finale à 72°C pendant 7 minutes. Un total de 74 allèles ont été détectés avec un nombre moyen d'allèles de 7,4 par locus. Une valeur moyenne de 0,74 du contenu en informations polymorphes (PIC) a montré l'existence d'une variabilité entre les accessions. Une valeur moyenne de diversité génétique de 0,77 a également été observée. L'approche SSR s'est avérée être un outil précieux dans la détermination de la diversité génétique et des relations entre les accessions de D. bulbifera . Ces résultats sont importants pour le programme de conservation et d'amélioration génétique de cette culture.