Journal of Carcinogenesis & Mutagenesis

Abstrait

Une méta-analyse de l'expression génétique des cellules tumorales du cancer du côlon et du rectum révèle des gènes associés à la tumorigenèse

Rutvi Vaja

Contexte : Chaque année, plus de 12 millions de personnes reçoivent un diagnostic de cancer colorectal (CCR) et plus de 600 000 personnes en meurent, ce qui en fait la deuxième forme de cancer la plus mortelle. Ce travail analyse l'expression différentielle des gènes dans les échantillons de CCR et d'autres tumeurs glandulaires afin d'identifier les changements d'expression contribuant potentiellement au développement de la tumorigenèse du CCR.

Méthodes : Ce travail définit 13 signatures génétiques représentant quatre tumeurs CRC et 10 autres tumeurs glandulaires d'origine colique. L'analyse d'enrichissement des ensembles de gènes (GSEA) est utilisée pour définir des panels de gènes CRC positifs et négatifs à partir de gènes de pointe identifiés par GSEA en utilisant deux signatures CRC. La GSEA est ensuite utilisée pour vérifier l'enrichissement et l'appartenance des gènes de pointe des panels CRC dans deux signatures de gènes CRC indépendantes. L'analyse est ensuite étendue à quatre signatures individuelles et à 10 signatures de tumeurs glandulaires. Les gènes les plus associés à la tumorigenèse CRC sont prédits en recoupant l'appartenance aux gènes de pointe identifiés par GSEA à travers les signatures.

Résultats : Un enrichissement significatif est observé entre les signatures d'identification des gènes du CRC, à partir desquelles les panels de CRC positifs (55 gènes) et négatifs (77 gènes) sont définis. Un enrichissement significatif non aléatoire est observé entre les panels de gènes du CRC et les signatures de vérification, à partir desquels 54 gènes surexprimés et 72 gènes sous-exprimés sont partagés entre les bords d'attaque. En considérant d'autres échantillons de tumeurs glandulaires individuellement et en combinaison avec le CRC, un enrichissement non aléatoire significatif est observé entre ces signatures. Huit gènes porteurs de solutés tels que (SLC25A32, SLC22A3, SLC25A20, SLC36A1, SLC26A3, SLC9A2, SLC4A4 et SLC26A2) du panel de CRC étaient partagés de manière commune entre tous les bords d'attaque des signatures génétiques, quel que soit le type de tumeur colique.

Conclusion : Cette méta-analyse identifie des modifications de l'expression génétique associées au processus de tumorigenèse du cancer colorectal. Ces modifications pourraient contribuer au développement de traitements thérapeutiques disponibles pour les patients atteints de cancer colorectal.