Journal de pathologie végétale et de microbiologie

Abstrait

Caractérisation génétique et phénotypique de Phytophthora colocasiae dans les zones de culture du taro en Inde

Vishnu Sukumari Nath, Shyni Basheer, Muthulekshmi Lajapathy Jeeva et Syamala Swayamvaran Veena

Des méthodes phénotypiques et moléculaires ont été utilisées pour caractériser 40 isolats de Phytophthora colocasiae obtenus dans les régions d'Andhra Pradesh, d'Assam, du Kerala et d'Odisha en Inde sur une période de cinq ans. Les paramètres phénotypiques tels que la virulence, la morphologie des colonies et le type de reproduction variaient parmi les isolats collectés dans différentes régions au fil des ans. Aucune corrélation n'a été observée entre les paramètres phénotypiques des isolats et leurs origines géographiques. Une variation inter et intra spécifique considérable a été détectée par analyse des microsatellites amplifiés aléatoirement (RAMS) avec un polymorphisme de 100 % parmi les isolats. Le dendrogramme construit sur la base des données RAMS en utilisant la méthode des groupes de paires non pondérées avec moyenne arithmétique (UPGMA) a regroupé les isolats de P. colocasiae en deux groupes principaux. Aucune relation n'a été obtenue entre les groupes RAMS des isolats et les caractères phénotypiques/l'origine géographique. L'analyse génétique de la population a montré que les isolats de P. colocasiae étaient très divers selon les régions. L'analyse de la variance moléculaire (AMOVA) a montré que la plus grande partie de la variabilité génétique de P. colocasiae était confinée à une population (93,21 %). Ces résultats indiquent que les populations de P. colocasiae en Inde sont très diverses et qu'il convient de faire preuve de prudence lors de l'élaboration de programmes de gestion des maladies ou de la sélection de cultivars résistants.