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Abstrait
Variation génétique parmi les Penicillia isolées à partir d'agrumes dans des conditions de stockage
Ahmad Ali Shahid, Mehra Azam, Muhammad Ali, Kiran Nawaz et Moazzam Anees
Le Pakistan est le sixième producteur mondial de Kinow (mandarine) et d'oranges, avec 2,1 millions de tonnes. Dans le cadre de cette étude, des marchés de fruits et légumes de Lahore ont été visités et quarante échantillons d'agrumes infectés ont été collectés, stérilisés en surface et inoculés sur un milieu gélosé dextrose de pomme de terre pour isolement. Selon la microscopie et les caractéristiques des colonies, cinq espèces du genre Penicillium (P. digitatum, P. expansum, P. biourgeianum) ont été identifiées. L'ADN génomique a été isolé et l'espaceur transcrit interne (ITS) a été amplifié en utilisant les amorces ITS 1 et ITS4 et les gènes 5.8S rRNA des champignons. Les produits de PCR purifiés et amplifiés ont ensuite été séquencés et l'homologie séquencée a été étudiée par BLAST et par recherche dans les bases de données de Genebank ou du logiciel NCBI. L'homologie de la séquence d'ADN a montré que les isolats contiennent plus de 98 % d'homologie avec les séquences d'ADN connues de P. expansum, P. digitatum et P. biourgeianum dans la banque de données génétiques. Parmi ces isolats fongiques, P. biourgieanum était une autre espèce nouvellement signalée isolée à partir d'agrumes infectés, et s'est vu attribuer le numéro d'accès KT336317 de la banque de gènes NCBI.