Biology and Medicine

Abstrait

Dosage GLAD-PCR des marqueurs de méthylation de l'ADN associés au cancer colorectal

Alexey A Evdokimov, Nina A Netesova, Natalia A Smetannikova, Murat A Abdurashitov, Alexandr G Akishev, Boris S Malyshev, Evgeniya S Davidovich, Vladimir V Fedotov, Vitaliy V Kuznetsov, Yuriy D Ermolaev, Andrey B Karpov, Alexey E Sazonov, Ravil M Tahauov et Sergueï Kh Degtyarev

L'hyperméthylation des régions régulatrices des gènes est documentée pour de nombreuses maladies cancéreuses. Une telle méthylation aberrante de l'ADN dans les cellules cancéreuses est catalysée par les ADN méthyltransférases Dnmt3a et Dnmt3b, qui reconnaissent et méthylent principalement les séquences RCGY avec formation de sites R(5mC)GY. Récemment, sur la base d'une nouvelle endonucléase d'ADN dirigée par méthyle GlaI, nous avons développé un test GLAD-PCR, qui permet de déterminer le site R(5mC)GY dans une position définie de l'ADN génomique. Dans ce travail, nous avons appliqué le test GLAD-PCR pour identifier les sites RCGY méthylés dans les régions régulatrices de certains gènes sous-régulés associés au cancer colorectal (CCR). Cette liste comprend les gènes ADHFE1, ALX4, CNRIP1, EID3, ELMO1, ESR1, FBN1, HLTF, LAMA1, NEUROG1, NGFR, RARB, RXRG, RYR2, SDC2, SEPT9, SFRP2, SOCS3, SOX17, THBD, TMEFF2, UCHL1 et VIM. L'analyse GLAD-PCR de sites RCGY sélectionnés dans les régions régulatrices de certains de ces gènes démontre un bon potentiel pronostique avec une sensibilité et une spécificité relativement élevées de détection du CCR dans l'ADN tumoral.