Journal de la technologie microbienne et biochimique

Abstrait

Identification et caractérisation des gènes gtf, norB et trx chez Flavobacterium Columnare

Yinfeng Zhang et Covadonga R. Arias

Trois gènes d'une bibliothèque génomique de la souche virulente ALG-00-530 de Flavobacterium columnare ont été identifiés, caractérisés et sélectionnés pour une analyse d'expression différentielle basée sur la similarité de séquence avec des gènes de virulence putatifs d'espèces apparentées. Ces gènes étaient : glycosyltransférase (gtf), réductase d'oxyde nitrique (norB) et thioredoxine (trx). Une collection de 30 souches de F. columnare, y compris des souches des génomovars I et II, a été testée pour la présence de ces gènes. Les schémas de distribution de gtf, norB et trx à travers les espèces n'étaient pas uniformes. Une variation de séquence nucléotidique a été observée entre les génomovars pour chaque gène ; cependant, les souches au sein du même génomovar partageaient des séquences géniques identiques. Neuf souches de F. columnare, des deux génomovars, ont été choisies pour une analyse d'expression génique. Le profil d'expression de ces gènes variait lorsque les souches sélectionnées étaient cultivées in vitro dans des conditions identiques. ALG-00-530, une souche hautement virulente, a été choisie pour comparer l'expression des gènes dans des conditions de croissance standard, dans des conditions de limitation du fer et en présence d'explants de peau de poisson-chat de rivière. Les niveaux d'expression des gènes NorB et trx ont varié lorsque ALG-00-530 a été incubé dans différentes conditions.