Journal de bactériologie et parasitologie

Abstrait

Identification des souches cliniques de Corynebacterium striatum par analyse de restriction par PCR à l'aide du gène de la sous-unité β de l'ARN polymérase (rpob)

Sana Alibi, Asma Ferjani, Manel Marzouk et Jalel Boukadida

Corynebacterium striatum est fréquemment rencontré dans les laboratoires de microbiologie clinique de routine. Il est largement disséminé dans l'environnement et constitue une partie de la microbiote normale de la peau et des muqueuses. L'identification de cette espèce par des méthodes biochimiques reste difficile et plusieurs erreurs d'identification ont été rapportées précédemment. Une méthode de polymorphisme de longueur des fragments de restriction par réaction en chaîne par polymérase (PCR-RFLP) pour l'identification de ce micro-organisme a été conçue sur la base de la région hypervariable du gène de la sous-unité β de l'ARN polymérase polymorphe (rpoB). Toutes les séquences rpoB de Corynebacterium disponibles ont été analysées par analyse de restriction assistée par ordinateur. Le profil rpoB PCR-RFLP prédit en utilisant les endonucléases MseI et NlaIV a clairement différencié C. striatum de toutes les autres espèces de Corynebacterium. Cette méthode a été appliquée avec succès pour l'identification fiable de 67 isolats cliniques de C. striatum et peut être utilisée pour la détection rapide des patients infectés ou pour des études épidémiologiques.