Journal de pathologie végétale et de microbiologie

Abstrait

Identification de la résistance à la rouille jaune chez le blé dur éthiopien par criblage phénotypique et marqueurs SNP PCR spécifiques d'allèle compétitif (KASP)

Sisay Kidane Alemu, Ayele Badebo, Kassahun Tesfaye, Cristobal Uauy

La rouille jaune causée par Puccinia striiformis f.sp. tritici (Pst) est l'une des maladies les plus dévastatrices du blé dans les hautes terres d'Éthiopie. Les cultivars améliorés perdent souvent leur résistance en raison de l'apparition de nouvelles races virulentes qui surmontent les gènes et rendent les cultivars hors production. Par conséquent, l'identification de nouvelles sources de gènes de résistance aide à lutter contre la rouille jaune et maximise la production de blé en Éthiopie. Dans cette étude, 300 lignées de blé dur (races locales et cultivars) ont été criblées avec trois isolats virulents ( Pst_Is1 , Pst_Is4 et Pst_Is8 ) pour la résistance des plantules en utilisant la méthode de notation du type d'infection (IT). Les lignées ont également été criblées avec 16 marqueurs SNP basés sur KASP liés à 7 gènes Yr déjà identifiés dans diverses études. Français Un type d'infection hautement résistant (IT : 0 -3) à Pst_Is1, Pst_Is4 et Pst_Is8 a été présenté par 59,3 %, 67,3 % et 46,3 % des lignées, respectivement. 124 lignées ont constamment présenté un niveau élevé de résistance aux trois isolats. La majorité (96,8 %) des lignées résistantes sont des races locales tandis que quatre (3,2 %) sont des cultivars commerciaux (Cocorit/71, Yerer, Obsa et Dire). Dans le criblage moléculaire, 12 des marqueurs ont donné des amplifications claires dans les lignées témoins et testées. Yr7 , Yr15 et YrSp ont été détectés dans 81,7 %, 88,3 % et 0,7 % des lignées respectivement tandis que Yr1 , Yr17 et Yr36 n'ont pas été détectés. La fréquence de détection était plus élevée dans les races locales (58,7 %) que dans les cultivars (32,8 %). La fréquence des combinaisons de gènes était la plus élevée (72,7 %) pour Yr7+Yr15, suivie de Yr15+YrSp (0,3 %). Dans l'ensemble, cette étude a permis de détecter les gènes Yr15 et YrSp , qui sont des candidats potentiels pour la sélection assistée par marqueurs pour la résistance à Pst chez le blé. En outre , elle a montré que l'identification des sources de résistance et la détection des gènes peuvent être facilitées par l'application combinée du phénotypage et du criblage moléculaire.