Biology and Medicine

Abstrait

Approches bioinformatiques intégratives pour analyser les événements moléculaires dans la pluripotence

Priyanka Narad et Upadhyaya KC

Les cellules souches embryonnaires humaines (hESC) ont la capacité de proliférer presque indéfiniment. L'analyse des profils d'expression génétique des hESC pourrait offrir un aperçu des gènes cruciaux impliqués dans le maintien de la pluripotence et des gènes qui peuvent être impliqués dans la différenciation cellulaire. La combinaison de données de réseau et de haut débit permet de comprendre le rôle des mécanismes épigénétiques, des voies de signalisation et des facteurs de transcription responsables de la pluripotence humaine et de cribler les relations mécanistes putatives, de valider les connaissances existantes, de générer des hypothèses et de suggérer de nouvelles expériences. Le décodage du noyau de facteurs et de leurs interactions associées est un début important pour comprendre les complexités associées aux hESC et transférer les connaissances pour la création de cellules souches pluripotentes induites humaines (hIPS). Cette revue vise à accroître les informations élémentaires des approches bioinformatiques intégratives utiles pour étudier les processus d'auto-renouvellement et de différenciation en utilisant de nouvelles données holistiques sur l'expression génétique et les marques épigénétiques associées à la pluripotence cellulaire. Deux approches de base, à savoir la représentation sous forme de réseaux biologiques et la technologie du web sémantique, ont été décrites pour la gestion des données à haut débit en constante augmentation. Une approche intégrée pour démêler les subtilités biologiques serait très bénéfique dans le domaine des sciences médicales et de la santé