Journal de recherche et de thérapie sur les cellules souches

Abstrait

Cellules stromales mésenchymateuses et morphogenèse vasculaire : profils d'expression génétique et voies de promotion

Rogier TA Van Wijck

RÉSUMÉ
Objectif : Les cellules hématopoïétiques et les cellules stromales mésenchymateuses sont étroitement liées aux cellules endothéliales dans les
lignées de différenciation cellulaire embryologique. Pour étudier la pathobiologie de l'immunologie vasculaire et du microenvironnement
dans la morphogenèse vasculaire, nous avons analysé les facteurs génétiques connus pour être impliqués dans les anomalies vasculaires chez l'homme
et la souris dans les données d'expression du projet de génome immunologique (ImmGen).
Méthodes : Nous avons exploité les bases de données Pictures of Standard Syndromes of Undiagnosed Malformations et NCBI Online
Mendelian Inheritance in Man pour construire une liste de gènes liés à la vascularisation. Nous avons étudié les
signatures d'expression de ces gènes dans la base de données ImmGen. Des analyses de clustering hiérarchique ont été réalisées à l'aide de Partek®
Genomics Suite 6.6. Ensuite, les clusters acquis ont été étudiés séparément dans le cadre d'Ingenuity Pathway Analysis
(IPA). Sur la base de ces résultats, nous avons effectué une analyse en composantes principales (ACP) avec des échantillons de péricytes provenant d'une
base de données distincte pour étudier la relation avec les péricytes.
Résultats : Nos requêtes dans la base de données ont abouti à une liste de 438 gènes liés à la vascularisation, dont 384 ont pu être
étudiés dans l'ensemble de données ImmGen. Grâce à un regroupement hiérarchique, nous avons identifié cinq groupes distincts dont l'
un était spécifique à l'expression dans les lignées cellulaires mésenchymateuses. Ensuite, en utilisant l'IPA, nous avons trouvé diverses voies liées aux
fonctions des péricytes. Une PCA ultérieure avec des échantillons de péricytes a montré une ressemblance étroite avec des cellules stromales spécifiques d'
origine mésenchymateuse, indiquant des profils d'expression partagés pour les gènes vasculaires entre les péricytes et ces types de cellules.
Ces résultats indiquent que les processus de transition épithéliale-mésenchymateuse et/ou
de transition endothéliale-mésenchymateuse sous-tendent l'interaction entre les cellules épithéliales/endothéliales et les cellules stromales mésenchymateuses dans
la morphogenèse vasculaire.
Conclusion : Dans cette étude d'analyse de données, nous avons réalisé une fusion de données provenant de diverses sources qui pourraient aider les futures
études mécanistiques et thérapeutiques dans la conception des études et la sélection du type de cellules, ainsi que fournir une stratégie potentielle
pour trouver des cibles thérapeutiques basées sur les mécanismes moléculaires pathologiques spécifiques liés aux anomalies vasculaires.