Journal de bactériologie et parasitologie

Abstrait

Approches moléculaires dans la détection et la caractérisation des leptospires

Ahmed Ahmed, Martin P. Grobusch, Paul R. Klatser et Rudy A. Hartskeerl

Le diagnostic conventionnel de la leptospirose et la caractérisation des Leptospira spp. reposent principalement sur la sérologie. L'inconvénient majeur de la sérologie dans le diagnostic est qu'elle nécessite des niveaux suffisants d'anticorps anti-Leptospira, ce qui compromet la confirmation dans la phase aiguë précoce de la maladie. Le test d'absorption d'agglutinine croisée (CAAT) qui détermine les sérovars de Leptospira est une méthode techniquement exigeante et laborieuse et n'est donc réalisée que dans quelques laboratoires. Les nouveaux tests de diagnostic moléculaire reposent principalement sur la réaction en chaîne par polymérase (PCR). La PCR complète parfaitement les tests sérologiques, car elle est particulièrement sensible dans les 5 premiers jours après l'apparition des symptômes. La PCR en temps réel est rapide et a été validée pour sa grande précision clinique. L'introduction de techniques moléculaires pour définir les espèces de Leptospira a révolutionné la catégorisation des souches de ce genre, car les espèces et les sérogroupes semblaient montrer peu de corrélation. Le test de référence dans la spéciation moléculaire est basé sur la détermination de l'homologie de l'ADN. Cette approche est fastidieuse et peu conviviale et est donc de plus en plus remplacée par d'autres techniques. À ce jour, il existe une multitude de méthodes de typage moléculaire. Les plus intéressantes sont celles qui fournissent des données numériques directes et électroniques portables. Ces techniques comprennent le polymorphisme de longueur de fragment amplifié par fluorescence (FAFLP), le typage par matrice, l'analyse multilocus à nombre variable de répétitions en tandem (MLVA) et la phylogénie basée sur les séquences, et dans une certaine mesure l'électrophorèse sur gel en champ pulsé (PFGE). Le typage de séquences multilocus (MLST) est la méthode la plus robuste pour déterminer la diversité des souches de Leptospira et ne sera probablement dépassée à l'avenir que par la phylogénie sur les séquences du génome entier.