Journal of Petroleum & Environmental Biotechnology

Abstrait

Caractérisation moléculaire des groupes phylogénétiques et fonctionnels bactériens de la baie de Terrebonne, le long du littoral du golfe du Mexique

Ola A Olapade

La détection et la quantification des groupes phylogénétiques et fonctionnels bactériens ainsi que de la diversité de la communauté sur le site de la marée noire de Deepwater Horizon dans la baie de Terrebonne, le long du golfe du Mexique, ont été réalisées à l'aide d'approches de coloration des acides nucléiques, d'hybridation in situ en fluorescence (FISH) et de clonage et de séquençage de gènes d'ARNr 16S. Les résultats de l'analyse de la bibliothèque de clones de gènes d'ARNr 16S ont révélé une forte occurrence de membres bactériens appartenant aux cyanobactéries (28 %), aux β-protéobactéries (21 %), aux bactéroïdes (17 %), aux actinobactéries (12 %) et aux α-protéobactéries (10 %). En particulier, les membres bactériens identifiés dans la bibliothèque de clones comme appartenant à la sous-classe des β-protéobactéries étaient principalement des dégradeurs d'hydrocarbures, notamment Methylibium petroleiphilum, Burkholderia cepacia, Hydrogenophaga taeniospiralis et les flagellés de Methylobacillus. Des analyses simultanées des communautés bactériennes planctoniques et benthiques par FISH ont révélé la dominance numérique des membres des bactéries méthanotrophes (MB) de type I sur les populations de type II. Les résultats de l'étude révèlent clairement un changement dans la structure et la composition de la communauté bactérienne en réponse aux tragiques rejets de méthane et de pétrole brut de la plate-forme Deepwater Horizon le long du golfe du Mexique.