Journal de bactériologie et parasitologie

Abstrait

Typage moléculaire des entérocoques/VRE

Guido Werner

En raison de leur fréquence accrue d'apparition en tant que pathogène nosocomial et donc de leur importance médicale globale accrue, la demande de caractérisation et de différenciation des souches d'Enterococcus faecalis et d'E. faecium a augmenté. Les techniques disponibles varient en termes de facilité d'utilisation, d'exigences en termes de coûts, de main-d'œuvre et de temps, de comparabilité et de reproductibilité inter- et intra-laboratoire des résultats, de portabilité des données et de pouvoir discriminant. L'analyse des épidémies par des techniques moléculaires sophistiquées nécessite des méthodes avec une discrimination différente des méthodes de détection et de suivi de la transmission des souches épidémiques sur des périodes de temps plus longues. Ce dernier est particulièrement critique pour les bactéries présentant un génome plutôt flexible comme Enterococcus. La valeur et l'application des techniques couramment utilisées pour le typage
des entérocoques (résistants à la vancomycine) sont discutées, notamment le ribotypage, le typage basé sur la PCR, l'analyse de macrorestriction en électrophorèse sur gel en champ pulsé (PFGE), le polymorphisme de longueur de fragment amplifié (AFLP), les analyses à nombre variable de répétitions en tandem à locus multiples (MLVA), le typage de séquences multilocus (MLST) et certaines approches spécialisées (typage de clusters de résistance, typage de plasmides, séquençage de nouvelle génération).