Siribhorn Madla, Daisuke Miura et Hiroyuki Wariishi
L'extraction des métabolites est considérée comme l'une des étapes les plus importantes du contrôle de la qualité dans la recherche métabolomique. Dans la présente étude, un protocole d'extraction optimal pour les métabolites intracellulaires fongiques a été étudié. Deux protocoles d'extraction avec différents systèmes de solvants, l'extraction au méthanol et l'extraction biphasique dans différentes conditions de pH ont été comparés. Le nombre de pics détectés, la variation d'un échantillon à l'autre et le débit de l'ensemble du processus ont été pris en compte comme critères. Les métabolites extraits ont été analysés par chromatographie en phase gazeuse couplée à la spectrométrie de masse (GC-MS) et analyse en composantes principales (PCA). Le protocole d'extraction utilisant le méthanol comme solvant d'extraction a fourni le plus grand nombre de pics détectés (~ 300 pics) avec facilité et rapidité, ce qui suggère que la méthode d'extraction au méthanol était adaptée à l'extraction des métabolites intracellulaires de P. chrysosporium. Cependant, selon la nature des métabolites d'intérêt, la méthode d'extraction biphasique dans différentes conditions de pH convient à une analyse ciblée.