Journal de pathologie végétale et de microbiologie

Abstrait

Caractérisation pathogénique et génétique des races Xanthomonas campestris Pv. campestris basée sur la Rep-PCR et l'analyse de séquences multilocus

Priyanka Singh Rathaur, Dinesh Singh, Richa Raghuwanshi et Yadava DK

Xanthomonas campestris pv. campestris (Pammel) Dowson (Xcc) est l'agent causal de la pourriture noire des crucifères dans le monde entier. Soixante-quinze isolats de Xcc ont été collectés dans 12 régions agroclimatiques de l'Inde pour déterminer le schéma de distribution des races et la diversité de la population. Sur la base de la réaction pathogénique sur sept crucifères différentiels standard, les races 1, 4 et 6 se sont révélées prévalentes. Pour évaluer la diversité pathogénique, quarante et un cultivars de crucifères comprenant sept espèces de Brassica et de coeno ont été inoculés artificiellement dans des conditions de terrain. Français Les cultivars de Brassica juncea (Pusa Bold, Varuna, Pusa Vijay, Pusa Mustard 21 et Pusa Mustard 25) ont montré une résistance contre toutes les souches de Xcc, tandis que le cultivar de Brassica olerecea Pusa Ageti s'est avéré résistant aux races 1 et 4. La caractérisation génétique de ces 75 souches de Xcc a été réalisée en utilisant la rep-PCR (ERIC, REP et BOXPCR) suivie d' une analyse phylogénétique . Les souches de Xcc ont été regroupées en 6 groupes avec un coefficient de similarité de 50 % et parmi ces groupes, 28 souches de Xcc appartenant aux races 1, 4 et 6 ont été regroupées sous le groupe 5. Les séquences des gènes 16S rRNA, hrpF et efP de cinq souches représentant les races 1, 4 et 6 ont été utilisées pour l'analyse de séquence multilocus. Sur la base de l'analyse des séquences des gènes 16S rRNA et hrpF, les souches indiennes se sont avérées être très étroitement liées à la souche Xcc ATCC 33913 (race 3, Royaume-Uni), tandis que sur la base des séquences efP, elles se sont avérées être étroitement liées aux souches race 1 Xcc B100 (Italie) et race 9 Xcc 8004 (Royaume-Uni).